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加速新冠肺炎药物研发,BAT滴滴向科研机构免费开放AI算力

本文摘要:以及基础的云计算能力;同时正式成立应急工作小组,协助加快疫苗研发和新药筛查。上述两个由获取算力反对的团队于是以分担新冠肺炎的药物检验和病毒变异预测工作。 早前,国家科技部应急启动了涉及的应急研究项目,中山大学药学院罗海彬教授团队选入了“2019-nCoV的保护性抗体、疫苗研发和药物检验与评价研究”的课题,负责管理甄选具备化疗起到的候选药物等工作。

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以及基础的云计算能力;同时正式成立应急工作小组,协助加快疫苗研发和新药筛查。上述两个由获取算力反对的团队于是以分担新冠肺炎的药物检验和病毒变异预测工作。

早前,国家科技部应急启动了涉及的应急研究项目,中山大学药学院罗海彬教授团队选入了“2019-nCoV的保护性抗体、疫苗研发和药物检验与评价研究”的课题,负责管理甄选具备化疗起到的候选药物等工作。为此,云很快调度了一批 GPU 服务器节点,并为罗教授团队通车了高性能计算出来账号,免费获取所有计算资源,反对罗教授的团队展开抵抗新型冠状病毒的药物检验和病毒变异预测。同时,北京生命科学研究所/清华大学生物医学交叉研究院黄牛教授实验室,正在前进基于新型冠状病毒靶标结构的化合物虚拟世界检验的工作。

为此获取了大量标准的 CPU 算力以及对象储存能力,协助黄牛教授实验室展开基于结构的药物分子设计的离线计算出来任务。针对新型冠状病毒的多个靶点,黄牛教授实验室通过云秒级交付给的海量高性能计算出来、存储资源,较慢计算出来检验数亿级别的化合物数据库,融合实验检验,来找寻新型结构类型的先导化合物,为下一步新药研发工作获取依据。总而言之,云较强的 CPU 以及 GPU 算力调度能力可以为基因测序、医疗工程获取平稳高效的算力反对,从而减少创意药物前期研发的成本与周期。

百度紧跟阿里和的脚步,百度研究院也在 2020 年 1 月 30 日宣告,将向各基因检测机构、防疫中心及全世界科学研究中心免费对外开放线性时间算法 LinearFold以及世界上现有最慢的 RNA 结构预测网站,以提高新型冠状病毒 RNA 空间结构预测速度,从而助力疫情防控。具体来说,2019 年 7 月,百度首次明确提出 LinearFold 算法,该算法让整序列、一整基因组的 RNA 结构预测沦为有可能,也是 RNA 结构预测领域的一次重大突破。

此次引发武汉肺炎的新型冠状病毒与 SARS 病毒、艾滋病毒、埃博拉病毒、流感病毒一样,都归属于 RNA 病毒,其单链结构造成病毒更容易变异、容易研发疫苗。但如果医学专家们需要更为较慢且了解地理解新冠肺炎基因组的性质,这将为针对性药物的设计研发获取最重要信息。传统上,RNA 二级结构预测必须三次方时间复杂度的算法。

比如说,序列长度刷一倍就要代价 8 倍的计算出来时间,像 RNA 病毒基因组这样的超长序列(例如,艾滋病毒有大约 1 万个碱基,埃博拉病毒有大约 2 万个碱基)必须很长一段等待时间。而冠状病毒(还包括非典病毒和这次的新型冠状病毒)的基因组又是所有 RNA 病毒里最久的,宽约 3 万个碱基,最慢的经典算法也必须 55 分钟。不过,通过百度 LinearFold 算法,这一计算出来时间被传输到了 27 秒,相等于提高了 120 倍。

与此同时,百度还向全球科学家免费对外开放了其 RNA 结构预测网站。这些都将提高基因检测、疫苗研发等科研中心的工作效率,让病毒的研究及疫苗研发速度较慢提升。值得一提的是,在此之前,百度还宣告正式成立总规模 3 亿元疫情及公共卫生安全性攻坚专项基金,用作反对新型冠状病毒肺炎等新的疾病的医治药物检验、研发等一系列抗击疫情工作。

滴滴云录:图片来自滴滴云2020 年 2 月 1 日,滴滴也重新加入了 BAT 的行列——滴滴云宣告,在通力确保长时间服务的基础上,正式成立应急战疫小组,并免费向国内科研机构、医疗及救助平台等对外开放用作抗击疫情涉及工作的 GPU 云计算资源和技术支持,还包括但不仅限于 GPU 云服务器、阻抗平衡 SLB、弹性公网 EIP 等以及涉及的技术支持服务。据理解,疫情期间,国内任何针对本次新型冠状病毒研究、药物研发的公共科研机构,医院、学校、以及线上医疗平台、免费教育资源获取方、防疫资源救助等涉及平台,都可联系滴滴云。

滴滴云回应,其将在第一时间全力因应,获取资源与技术支持,为打下疫情防控战役贡献力量。原创文章,予以许可禁令刊登。下文闻刊登须知。


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